菌痢全称为细菌性痢疾，是夏秋两季小儿的多发病，临床常以腹痛、腹泻、呕吐、发热、里急后重、脓血便等为其主要症状。小儿一旦患了菌痢应及早用药，以控制病情的恶化。治疗小儿菌痢的首选药，大致有如下几种。
复方新诺明，主要优点是毒性小，疗效高，副作用少，半衰期长，抗菌谱广。用量：每公斤体重每日25毫克，分两次口服，宜安排在早晚饭后。服药后要多给患儿喝些水。一个疗程为3—7天，若需大剂量或长期服用，应加服适量碳酸氢钠，以避免或减轻肾脏损害。早产儿、不足3个月的婴儿、肝肾功能不良者及对磺胺过敏者均应禁用。此药不可与乳酶生、促菌生、酵母片等助消化药同服，以免降低后者的疗效。
磷霉素钙为一种广谱抗生素，与其他药物没有交叉耐药性。用量：每公斤体重每日50—100毫克，分3—4次口服。此药不良反应较少，主要为胃肠道反应，如恶心、食欲差等。
庆大霉素，肌肉注射量每公斤体重每日3—4．5毫克，分3次注射。此药可静滴，但疗程宜控制在10天左右。目前临床有人提议用其口服，观察效果也很好。此药常用量对肾脏、听力无明显影响，仅有少数患儿出现管型尿、蛋白尿等，国内统计发生率约为2％。
痢特灵，化学名叫呋喃唑酮。用量：每公斤体重每日5—10毫克，分3次口服，疗程5—7天。可与复方新诺明同服，以增强疗效。此药口服不易吸收，故毒性较低，仅有轻度恶心、头晕等反应。
肠炎灵，为一种高效抗菌收敛药。成人每次4粒，每日一次口服。小儿按年龄酌减。服药期间尿液为红色，停药后即恢复正常。顺便值得提的是，小儿菌痢初期不宜使用止泻药，如止泻片、炭片、矽炭银、鞣酸蛋白等。这是因为，菌痢患儿要通过排便，方能将肠道内的病菌及细菌毒素排出体外，因此，腹泻有利于病体的恢复。
但若过早地使用止泻药，就很难将患儿体内的病菌及毒素排出体外，往往会使病情加重，病程延长。故菌痢患儿，应多喝水，多排便，高烧者可给退热剂或进行物理降温，如酒精擦浴等。另外，小儿在腹泻期间，宜少给糖水喝。因为糖在肠内容易发酵，反而会使腹泻加重。
